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软件开发资讯 文件解读

发布日期:2024-08-25 13:33    点击次数:67

关节词:液体活检;基因测序;变异检测;

文件简介标题(英文):Serial circulating tumor DNA to predict early recurrence in patients with hepatocellular carcinoma: a prospective study标题(汉文):联结轮回肿瘤DNA检测可展望肝癌患者早期复发:一项前瞻性接续发表期刊:Molecular Oncology作家单元:复旦大学中山病院等发表年份:2021著述地址:https://doi.org/10.1002/1878-0261.13105

图1 文件简介

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肝细胞癌是大众第六大常见癌症,亦然患者牺牲的第三大常谅解因。若何灵验监测肝癌肝切除患者的肿瘤复发或推崇,关于改善患者糊口期间至关进军。该接续应用41 个患者的血浆 cfDNA、胚系DNA 以及肝癌组织 DNA 样本接续了轮回肿瘤 DNA(ctDNA)在展望肝癌(HCC)患者术后早期肿瘤复发和检测肿瘤负荷方面的价值。接续效果标明,ctDNA 是一种很好的及时监测缠绵,不错准确响应肿瘤负荷。基线 ctDNA 的中位VAF 是肝癌患者无复发糊口期(RFS)的强安靖展望因子。在数据分析方面,该接续中癌旁组织和肝癌组织的外显子测序数据使用 Sentieon DNAseq 模块进行比对、质控缠绵统计、去相易、InDel 重排及 BQSR 等,使用 Sentieon TNseq 模块进行配对样本的体细胞突变检测。

测序经过

图2 突变全景过头与预后的关系

(A)41例HCC患者的突变景不雅,知道每个患者的体细胞突变数目(上),每个基因的突变频率(右)。(B)ctDNA和HCC组织突变谱的比较,知道每个基因(顶部)和每个患者编号(左)的突变信息。(C)手术前复发(n = 9)和不复发(n = 32)之间的突变互异。(D)手术后复发(n = 9)和不复发(n = 32)之间的突变互异。(E)NRAS,MET和NEF2L2突变与肿瘤复发之间的关系。n = 13 默示更动组,n = 28 默示未更动组。

图3 基线ctDNA的突变中位VAF与肿瘤复发和临床参数之间的关系

(A)不同复发现象患者术前ctDNA的中位VAF永别(复发组n = 13,无复发组n = 28)。(B)术前ctDNA中位VAF的Kaplan-Meier分析。(C)基线 AFP 水公谈常患者术前 ctDNA VAF 中位数的 Kaplan-Meier 分析。(D)无MVI患者术前ctDNA中位VAF的Kaplan-Meier分析。

图4 Sentieon的作用

Sentieon软件团队领有丰富的软件设立及算法优化工程训戒,死力于于处置生物数据分析中的速率与准确度瓶颈,为来自于分子会诊、药物研发、临床医疗、东谈主群部队、动植物等多个规模的互助伙伴提供高效精确的软件处置决议,共同激动基因技艺的发展。 法子2023年3月份,Sentieon依然在大众范围内为1300+用户提供行状,被天下一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等平庸援用,援用次数卓著700篇。此外,Sentieon联结数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个巨擘评选的桂冠,在业内取得平庸招供。文件接洽

图5 文件接洽

ctDNA在癌症(包括HCC)临床中具有变革后劲,能无创监测突变推崇,展望复发和预后。但在HCC中,软件开发多少钱ctDNA突变检测仍面对挑战,与其他癌症比拟存在局限性。尽管传统临床病理特征如组织学分级、肿瘤大小等被用于展望复发,基因组特征后劲高大,但不同接续门径和基因面板导致效果不一致,需进一步探索。

归来

说七说八,ctDNA是一种精确的动态肿瘤生物记号物,不错及时响应HCC患者的肿瘤负荷。该接续评释了ctDNA检测和VAF检测不错算作调养前早期复发的预后身分。此外,接续者不雅察到NRAS,MET和NFE2L2基因突变可能展望早期肿瘤复发。串联ctDNA分析联结肿瘤组织基因组测序不错为展望和监测肿瘤复发提供精确的信息,并有助于优化个体化的多形式调养政策。

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从间歇期归来面对梅州客家开始,泰山队内部的氛围一直不算融洽。其实,问题也很简单。当因为补税问题引发球员收入锐减时,球员的动力以及斗志无法保证,自然比赛踢起来也是磕磕绊绊。泰山队主帅崔康熙自然也明白问题所在,虽然他也在尝试着继续给予球队前进的动力软件开发资讯,但他能做的,可谓杯水车薪。

发布于:广东省