开发一个软件 东说念主工智能瞎想出数千个新DNA开关
科技日报北京10月23日电 (记者张梦然)据《当然》杂志23日发表的论文,好意思国杰克逊施行室、麻省理工学院和哈佛大学布罗德磋磨是以及耶鲁大学的团队欺诈东说念主工智能(AI)时代瞎想出数千个新的DNA开关。这些新瞎想的元件约略精确鸿沟基因在不同类型细胞中的抒发,为东说念主类健康与医学磋磨提供了前所未有的可能性。
尽管频年来,基因剪辑和其他基因调整技巧已让科学家约略在活细胞中修改基因,但要在不干扰统共这个词生物体的情况下,只对某一类型的细胞进行基因干预,仍是存在挑战。这主如果因为关于鸿沟基因开启和关闭的DNA开关——顺式调整元件(CRE)的领略还不够深刻。这次更正的中枢在于,新步调不错针对特定的细胞类型来普及或缩短基因抒发,却不会影响到肉体其他部分。
团队采纳了深度学习算法,基于数十万个东说念主类基因组中的DNA序列考验了一个模子。通过这个模子,他们可在施行室环境中测量3种细胞(血液、肝脏和大脑)中CRE的活性。该AI模子可估计随性序列的活性,从而揭示了DNA中新的情势以及CRE序列的语法是若何影响RNA生成量的。
基于上述发现,团队构建了名为CODA(蓄意优化DNA活性)的平台。通过聚合施行数据和蓄意建模的迭代历程,该平台束缚修订其估计CRE生物学效应的智力,见效瞎想出了当然界中未尝出现过的CRE。
经过测试,新瞎想的合成CRE阐扬出了比自然存在的CRE更优异的细胞类型特异性。它们不仅包含了促进决议细胞类型中基因抒发的序列,开发一个软件还含有禁绝非决议细胞类型中基因抒发的元素。现在,团队已在斑马鱼和小鼠身上考证了几种合成CRE序列的有用性。
这一败坏性进展意味着,改日可能达成愈加精确和个性化的基因疗法,为贯注和调整疾病勾引了新阶梯。
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app在生物体内,并不是统共基因齐会在合适的细胞和合适的时刻点解析作用。CRE的功能,就在于确保相宜的基因在正确的时刻、正确的场合被激活。比喻,幸免皮肤细胞使用了大脑所需的基因,或是驻扎成东说念主体内激活仅在早期发育阶段需要的基因。这次团队不仅合成了全新的CRE,还展示了若何使用这些CRE选拔性地激活大脑、肝脏或血液细胞中的基因开发一个软件,同期确保这些基因在其他类型的细胞中保抓千里默。这在生物医学和时代上具有双重进击有趣。